Delphine NICOLAS

Thèmes : Conservation des Espèces | Gestion et restoration des écosystèmes naturels et agricoles

Contact : e-mail | Tél. +33 (0)4 90 97 29 80

Date d’arrivée : décembre 2015

Profil : Research Gate

Intérêts de recherche et expertises

Mes recherches visent à mieux comprendre :

• la distribution spatio-temporelle des espèces à partir d’approches macroécologiques (larges séries spatiales et/ou temporelles)
• la dynamique des populations à l’aide de suivis sur le long-terme en capture-marquage-recapture.

Mon travail s’inscrit dans un objectif de conservation et de gestion d’espèces endémiques du bassin méditerranéen dans un contexte de changement global.

Actuellement, je travaille plus particulièrement sur deux espèces menacées dans deux terrains de jeu différents : l’Anguille européenne en Camargue et la Truite marbrée en tête du bassin de la Soča en Slovénie. Je m’intéresse à l’impact des évènements extrêmes (crue, sécheresse, glissement de terrain), ainsi qu’à l’arrivée d’espèces introduites, telles que le Silure glane et le Pseudorasbora en Camargue, ou la Truite commune et la Truite arc-en-ciel en Slovénie.

Projets

En Camargue, des canaux d’eaux douces aux marais salés :

• Depuis 1993 : Suivi mensuel sur le long terme du peuplement piscicole et carcinologique du canal du Fumemorte (voir le projet).
• Depuis 1993 : Suivi des différents stades de l’Anguille européenne à la Capelière dans l’étang du Vaccarès.
• Depuis 2001 : Suivi en capture-marquage-recapture de l’Anguille européenne dans le Canal du Fumemorte (voir le projet).
• 2016 – 2021 : Suivi de la connectivité hydrobiologique dans les étangs et marais des salins de Camargue. Suivi du recrutement d’espèces en provenance de la mer (stade civelle de l’Anguille européenne, espèces de poissons marines migratrices comme la Sole, le Bar ou la Dorade, et crustacés décapodes tels que le Crabe vert et la Crevette grise). Suivi de la dévalaison de l’Anguille européenne (voir le projet).
• • Depuis 2019 : Suivi télémétrique par radio-identification (RFID) mis en place dans le bassin du Fumemorte afin d’étudier les déplacements longitudinaux de l’Anguille européenne au stade jaune entre l’étang du Vaccarès et le canal du Fumemorte, ainsi que les dynamiques de dévalaison au stade argentée.

  2020-2021 : Méta-analyse du recrutement en civelles à l’échelle du delta de Camargue.

En Slovénie, en tête du bassin de la Soča :

• Depuis 1993 : Projet de la truite marbrée en collaboration avec l’association de pêche de Tolmin, Slovénie. Suivi de la dynamique de populations de truites marbrées génétiquement pures, de populations naturalisées de Truite commune et de Truite arc-en-ciel, en allopatrie ou en sympatrie (voir le projet).

Collaborations scientifiques

• 2019 – 2020 : Développement d’un indicateur Poissons en lagunes adapté au contexte français, Projet INPOLAG (Indicateur Poisson Lagune). Avec Ifremer, UMR MARBEC / Université de Montpellier, CEFREM / Université de Perpignan.
• 2019 -2020 : Utilisation de l’Épinoche à trois épines pour étudier les effets d’un cocktail de pesticides issus de la riziculture en Camargue, en condition de salinité variable : influence des mécanismes de sélection rapide sur la réponse écotoxicologique. Avec l’UMR MARBEC / Université de Montpellier, l’UMR SEBIO / INERIS et la Réserve naturelle nationale de Camargue.
• 2018 – 2019 : Participation au projet ROSETTA, mise en place d’un réseau de surveillance de l’agent Rosette, pathogène sainement porté par le Goujon asiatique (Pseudorasbora parva) pouvant avoir un impact sur les autres espèces de téléostéens. Avec l’AFB, l’IRD, la FNPF.

Encadrements de post-doctorants, doctorants et personnels non-permanents

• Hoste, Amélie, 2021-2024. Croissance de l’anguille européenne en milieu lagunaire méditerranéen : comparaison inter-habitats de la démographie, des dynamiques migratoires et de la condition des futurs géniteurs. Thèse. École doctorale ED 251. Directeur de thèse : Jean-Christophe Poggiale, Professeur Université de Marseille CNRS M.I.O. (UMR 7294 – UM 110). Co-encadrante : D. Nicolas, Tour du Valat.
• Testi, Baptiste. 02-04/2022. Analyses des chroniques de température enregistrées sur 25 sites dans le haut bassin de la Soca en Slovénie. CDD Ingénieur d’études.
• Bouchard, Colin. 2020-2021. Méta-analyse du recrutement des civelles : Synthèse et analyse de la continuité écologique à l’échelle du delta de Camargue. Postdoctorat. Co-encadrement : Olivier Boutron, et Hilaire Drouineau et Patrick Lambert de l’INRAE Bordeaux

Encadrements de stagiaires

• Vey Payre, Hugo. 2022. Comparaison de la croissance de l’anguille européenne entre différents habitats lagunaires par otolithométrie. Stage de Master 2, Ecologie/éthologie, Université Jean Monnet à St Etienne. Co-encadrants : D. Nicolas, E. Amilhat & E. Faliex (CEFREM/Université de Perpignant) & C. Tétrel (OFB)
• Mollier, Esther. 2021. Caractérisation de la dynamique de dévalaison de l’anguille européenne dans un canal de drainage camarguais. Stage de fin d’études (Master 2), Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l’Alimentation et de l’Environnement de Dijon. Co-encadrement : D. Nicolas & C. Bouchard
• Giraud, Jules. 2020 Evaluation de l’efficacité de détection d’un dispositif de télémétrie RFID. Stage M1 de 3 mois dans le cadre d’une année de césure tutorée à l’institut SupAgro de Montpellier. Co-encadrement : D. Nicolas & C. Bouchard
• Dupont, Luna. 2019-2020. Découvertes de suivis scientifiques piscicoles. 3 stages de 3 semaines en 1^ère et Terminal BAC PRO, Gestion des Milieux Naturels et de la Faune, Lycée des Calanques, Marseille
• Parent, Maude. 2019. Évaluation de la connectivité hydrobiologique entre le milieu marin et le complexe lagunaire du Vaccarès via les étangs et marais des salins de Camargue. Stage Master 2 Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse
• Marc, François. 2019. Mise en place d’un suivi piscicole. Stage BTS Gestion et Protection de la Nature 1^ère année, Cours Diderot, Aix-en-Provence
• Mutel, Stéphane. 2018. Variabilité temporelle de l’écologie trophique du silure glane et de l’anguille européenne dans un canal de drainage en Camargue. Stage Master 2 Polytech Tours – DPT Génie de l’aménagement, Université de Tours. Co-encadrement : D. Nicolas & C. Musseau (IGB, Berlin)
• Chericoni, Nicolas. 2017. Comparaison de deux suivis temporels de la faune piscicole dans l’Etang du Vaccarès. Stage Master 2 Statisitiques des Sciences de la Vie et de la Santé. Co-encadrement : D. Nicolas & A. Cheiron (SNPN/RNNC)
• Chevallier, Adrien. 2016. Transfert de l’ichtyofaune du Rhône vers la Camargue par le pompage d’irrigation. Stage de fin d’études, École Polytechnique Universitaire de Montpellier

Encadrements de volontaires (services civiques et services volontaires européens)

Appui technique pour plusieurs suivis de pêche. Entretien et réparation de matériel. Identification des espèces piscicoles et carcinologiques. Biométrie et saisie de données. Rédaction de compte rendus de missions illustrés. Confection d’outils de communication pour le grand public. Réalisation de projets personnels.

• 2022-2023 : Lefebvre, Chloé & Metayer-Rouchaleou, Margot
• 2021-2022 : Verbrugghe, Klervi
• 2020-2021 : Crassard, Tom
• 2020 : Boulongne, Patrice
• 2018 : Milesi, Dorian
• 2017 : Ferjančič, Kim
• 2016-2017 : Leborne, Florian

Formation initiale

2006-2010 : Doctorat en Ecologie estuarienne, Irstea Bordeaux / Université de Bordeaux1

2004-2006 : Master Océanographie spécialité Biologie & Ecologie marine, Centre Océanologique, Université de la Méditerranée, Aix-Marseille II

2003-2004 : Licence Biologie des Organisme, Programme ERASMUS, University of St Andrews

2001-2003 : DEUG Science de la Vie, Université de Nice Sophia-Antipolis

Publications

Retrouvez ci-dessous les dernières publications de Delphine Nicolas, ou la liste intégrale sur le portail documentaire de la Tour du Valat :

• How does the efficiency of Nanopore compare to Illumina sequencing in tracking the spread of aquatic invasive species?
  de Théo Deremarque, Rodolphe Elie Gozlan, Ravo Ravaozafindrasoa, Giuliano Mucci, Lucie Delalex, Jean-Michel Foissy, Michael Cagnant, Mathieu Clair, Justina Givens, Fabienne Justy, et al. In Water Biology and Security, (en ligne) (May, 2025), 100423 En ligne : www.sciencedirect.com[...] eDNA-based methods offer a non-invasive, easy-to-use approach for monitoring aquatic ... read more
• Investigating the quality of European silver eels by quantifying contaminants and parasite infestation in a French Mediterranean lagoon complex
  de Amélie Hoste, Raphaël Lagarde, Elsa Amilhat, Colin Bouchard, Paco Bustamante, Adrian Covaci, Elisabeth Faliex, Emmanuelle Migne, Giulia Poma, Claire Tetrel, et al. In Environmental Science and Pollution Research, (en ligne) (January, 2025) En ligne : doi.org[...] Coastal lagoons are diverse habitats with significant ecological gradients, which provide ... read more
• Life-history traits of the invasive and biggest European freshwater fish, the wels catfish (Silurus glanis) show high potential for colonisation in Southern Europe
  de Jacques Panfili, Delphine Nicolas, Khady Diop, Alain J. Crivelli In Marine and Freshwater Research, 75(18) (December, 2024) En ligne : www.publish.csiro.au[...] The invasive wels catfish is spreading to many European waterbodies and is the subject of controversy concerning its environmental impact.The objective was to investigate its life-history ... read more
• Ease and Limitations in Using Environmental DNA to Track the Spread of Invasive Host–Parasite Complexes: A Case Study of the Freshwater Fish Pseudorasbora parva and the Cryptic Fungal Parasite Sphaerothecum destruens
  de Théo Deremarque, Rodolphe Elie Gozlan, Ravo Ravaozafindrasoa, Giuliano Mucci, Lucie Delalex, Jean-Michel Foissy, Michael Cagnant, Mathieu Clair, Justina Givens, Fabienne Justy, et al. In Fishes, 9(12) (December, 2024), 477 En ligne : www.mdpi.com[...] The spread of non-native species threatens biodiversity and exacerbates societal challenges like food security. ... read more
• European eel (Anguilla anguilla) survival modeling based on a 22-year capture-mark-recapture survey of a Mediterranean subpopulation
  de Amélie Hoste, Colin Bouchard, Jean-Christophe Poggiale, Delphine Nicolas In Journal of Fish Biology, Online version (October, 2024) En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...] Since the 1980s, the European eel (Anguilla anguilla) has declined by over 90% in recruitment across its European and North African distribution area. This diadromous fish ... read more
• Estimating migration speed of glass eels during their colonization of a Mediterranean lagoon
  de Colin Bouchard, Delphine Nicolas In Journal of Fish Biology, 103(5) (November, 2023), 9 En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...] Migration speed can have important evolutionary consequences as it can affect the timing of arrival, remaining energy reserves, and habitat choice. Environmental conditions and individual phenotypic traits can impact the ... read more
• Patterns of genetic variation in native and non-native populations of European catfish Silurus glanis across Europe
  de Paul Castagné, Ivan Paz-Vinas, Stéphanie Boulêtreau, Jessica Ferriol, Geraldine Loot, Charlotte Veyssière, Robert Arlinghaus, Robert Britton, Marlène Chiarello, Emili Garcia-Berthou, et al. In Biodiversity and conservation, Online April (April, 2023) En ligne : link.springer.com[...] Biological invasions are a major component of global change worldwide. But paradoxically, an ... read more
• Spatio-temporal variations in glass eel recruitment at the entrance pathways of a Mediterranean delta
  de Colin Bouchard, Hilaire Drouineau, Patrick Lambert, Olivier Boutron, Delphine Nicolas In ICES Journal of Marine Science, 79(6) (August, 2022), 1874-1887 En ligne : doi.org[...] Understanding spatio-temporal dynamics of glass eel recruitment is necessary to characterize eel population status and the stock of future elvers. Despite numerous studies ... read more
• Impacts of environmental conditions and management of sluice gates on glass eel migration
  de Colin Bouchard, Olivier Boutron, Jordane Labremon, Hilaire Drouineau, Patrick Lambert, Delphine Nicolas In Estuarine, Coastal and Shelf Science, Online (November, 2022), 108139 En ligne : www.sciencedirect.com[...] Anthropogenic barriers such as tidal gates impair animal migration and ecological continuity. For migratory fishes, barriers may alter or impeach both ... read more
• Cancer Susceptibility as a Cost of Reproduction and Contributor to Life History Evolution
  de Antoine M. Dujon, Justine Boutry, Sophie Tissot, Jean-François Lemaître, Amy M. Boddy, Anne-Lise Gérard, Alexandra Alvergne, Audrey Arnal, Orsolya Vincze, Delphine Nicolas, et al. In Frontiers in Ecology and Evolution, Online (May, 2022), 18 En ligne : www.frontiersin.org[...] Reproduction is one of the most energetically demanding life-history ... read more