La Tour du Valat est un institut de recherche scientifique pour la conservation des zones humides méditerranéennes basé en Camargue, (France), sous le statut de fondation privée reconnue d’utilité publique. Fondée en 1954 par Luc Hoffmann, l’institut a depuis lors développé son activité de recherche avec un souci constant : mieux comprendre ces milieux – les zones humides sont l’écosystème le plus prodigue et le plus menacé de la planète – pour mieux les gérer. Convaincue que les zones humides méditerranéennes ne pourront être préservées que si activités humaines et protection du patrimoine naturel vont de pair, la Tour du Valat développe depuis de nombreuses années des programmes de recherche et de gestion intégrée qui favorisent les échanges entre usagers et scientifiques, mobilise une communauté d’acteurs et promeut les bénéfices des zones humides auprès des décideurs.
La Tour du Valat emploie environ 90 personnes, ainsi qu’une vingtaine de services civiques, volontaires européens et doctorants. Elle héberge également plusieurs autres structures (associations, service de l’OFB).
Pour plus d’informations : https://tourduvalat.org/ [1]
La Tour du Valat recrute un·e stagiaire pour l’étude de l’utilisation des espaces agricoles par les oiseaux d’eau
Contexte
Les activités humaines ont profondément transformé les paysages modifiant la structure des écosystèmes (Waters et al. 2016; Galetti et al. 2018). En particulier, à la suite des avancées technologiques survenues au milieu du XXᵉ siècle, l’agriculture dans les pays occidentaux a connu une intensification continue, conduisant au développement de monocultures au détriment des zones humides existantes (Perennou et al. 2012; Fluet-Chouinard et al. 2023; Rigal et al. 2023; Mediterranean Wetlands Observatory et al. 2025). Les interactions entre l’être humain et la faune sauvage existent, notamment en raison de la compétition pour l’accès aux habitats et aux ressources (Nyhus 2016). Les problèmes surviennent lorsque les animaux sauvages endommagent les cultures (König et al. 2020). L’augmentation des effectifs de grands oiseaux autrefois menacés tels que flamants, grues, oies et cygnes en Europe entraîne parfois des dommages aux cultures le long de leurs voies de migration.
Les milieux agricoles camarguais constituent pour les flamants comme pour les grues des milieux de substitution aux milieux naturels, présentant une grande prévisibilité d’accessibilité à des ressources très profitables. Certains flamants roses occasionnent des dégâts dans les rizières lors de la mise en eau pour les semis entre avril et juin. Par ailleurs, la présence des grues dans les semis de céréales, en particulier les champs de blé, colza ou couverts végétaux, entre novembre et janvier, occasionne aussi parfois des dégâts. Si les dégâts concernent chaque année une surface de culture réduite, ils sont localement impactants pour l’agriculteur induisant un manque à gagner important.
L’effarouchement par divers moyens est la principale méthode utilisée pour tenter de limiter les incursions. Ces effarouchements font l’objet de mesures dérogatoires mais celles-ci ne sont pas obtenues systématiquement car les méthodes sont souvent peu spécifiques, et que l’efficacité des méthodes d’effarouchement sont mal évalués. De plus, les systèmes d’effarouchement semblent perdre en efficacité au cours des années en raison d’une accoutumance des oiseaux observée vis-à-vis du matériel utilisé.
La Tour du Valat et le Parc naturel régional de Camargue travaillent depuis plusieurs décennies aux côtés des agriculteurs du territoire de Camargue pour limiter les risques d’incursions des flamants roses dans les semis de riz printanier et depuis quelques années sur les incursions des grues dans les milieux agricoles sensibles.
Objectifs
Mieux comprendre les déplacements des oiseaux d’eau effarouchés pour les dégâts qu’ils occasionnent afin de mettre en place des pratiques d’effarouchement plus ciblées et plus efficaces.
L’objectif premier est d’analyser les déplacements des flamants roses équipés de GPS lors de la période de semis du riz, en considérant à la fois l’utilisation des habitats naturels et agricoles, ainsi que la réaction des oiseaux aux effarouchements mis en place. En premier l’étude portera sur la Camargue mais elle sera complétée par des analyses dans le delta de l’Ebre en Espagne et le delta du Po en Italie à titre comparatif.
Un autre objectif consiste à analyser les déplacements et utilisation de l’habitat par des espèces non ciblées par l’effarouchement telles que les ibis falcinelles, hérons pourprés, mouettes mélanocéphales, sternes hansels. Enfin, si les données disponibles sont suffisantes, une analyse similaire sera réalisée sur l’utilisation de l’espace par les grues cendrées en hiver en Camargue, en considérant la part de l’utilisation des cultures sensibles aux dégâts par cette espèce et la réaction aux pratiques d’effarouchement.
Mission
Le stage comportera différents volets :
- Collecte des données disponibles auprès des propriétaires de données (chercheurs, agriculteurs, détenteurs de données de télédetection), rédactions de conventions, nettoyage et filtrage ;
- Développement de modèles statistiques et analyses ;
- Rédaction d’un rapport sous forme d’article scientifique pouvant faire l’objet d’une valorisation dans un journal international
Profil et compétences
- Bac+ 5 Master/Ingénieur
- Connaissances indispensables en statistiques (maîtrise de R, connaissances des outils de modélisations, en particulier spatiales)
- Expérience en analyses de données de suivis par balises GPS
- Bonne connaissance de l’écologie des oiseaux
- Compréhension des enjeux, contraintes et systèmes agricoles
- Bonne capacité relationnelle avec les acteurs agricoles, institutionnels, de la conservation et de la recherche
- Bonne capacité d’expression orale et de rédaction écrite en français et en anglais
Aspects pratiques
- Lieu de travail : Tour du Valat – Le Sambuc, 13200 Arles, France
- Période du stage : Flexible, entre 1er février et 31 août 2027
- Durée : 6 mois
- Hébergement possible sur site en fonction de la disponibilité: Chambres à partager (2 lits) avec un loyer de 66,70 €/mois (valeur 2026) avec Cuisine et sanitaires en commun
- Véhicule de service fourni en cas de déplacement. Notez qu’il n’est pas prévu de terrain pour le besoin du stage excepté une participation ponctuelle à une tentative de captures de flamants adultes (sous réserve de conditions favorables)
- Stage indemnisé selon dispositions légales : 4€50/heures (valeur 2026)
- Cantine disponible pour les repas du midi – formules classique et végétarien : 3,25€/repas (valeur 2026)
Responsable de stage
Jocelyn Champagnon [2], directeur de recherche à la Tour du Valat
Partenaires et personnes ressources
Le stage implique différents experts, collaborateurs et fournisseurs de nombreux et divers qui pourront être sollicités pour atteindre les objectifs du stage. En particulier :
- Arnaud Béchet, directeur de recherche, Tour du Valat
- Antoine Arnaud, ingénieur de recherche, Tour du Valat
- Thomas Blanchon, technicien de recherche, Tour du Valat
- Anne Vadon, Parc naturel régional de Camargue
- François Clément, Centre Français du Riz / Syndicat des Riziculteurs de France et Filière
- Lorenzo Serra, Istituto Superiore per la Protezione e la Ricerca Ambientale (ISPRA), Italy
- Davide Scridel, DOPPS BirdLife Slovenia
- Antoni Curcó Masip, Parc Natural del Delta de l’Ebre
- Ivar Ojaste, Estonian University of Life Science
- Frédéric Jiguet, Museum National d’Histoire Naturelle
- Olivier Duriez, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
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Références
Fluet-Chouinard E., Stocker B.D., Zhang Z., Malhotra A., Melton J.R., Poulter B., Kaplan J.O., Goldewijk K.K., Siebert S., Minayeva T., Hugelius G., Joosten H., Barthelmes A., Prigent C., Aires F., Hoyt A.M., Davidson N., Finlayson C.M., Lehner B., Jackson R.B., McIntyre P.B. 2023. Extensive global wetland loss over the past three centuries. Nature 614:281–286. doi: 10.1038/s41586-022-05572-6
Galetti M., Moleón M., Jordano P., Pires M.M., Guimarães Jr. P.R., Pape T., Nichols E., Hansen D., Olesen J.M., Munk M., de Mattos J.S., Schweiger A.H., Owen-Smith N., Johnson C.N., Marquis R.J., Svenning J.-C. 2018. Ecological and evolutionary legacy of megafauna extinctions. Biological Reviews 93:845–862. doi: 10.1111/brv.12374
König H.J., Kiffner C., Kramer-Schadt S., Fürst C., Keuling O., Ford A.T. 2020. Human–wildlife coexistence in a changing world. Conservation Biology 34:786–794. doi: 10.1111/cobi.13513
Mediterranean Wetlands Observatory, Guelmami A., Ronse M., Galewski T., Gaget E., Bègue N. 2025. Mediterranean Wetlands: responses to ongoing crises. [Internet]. Arles: Tour du Valat. Retrieved from https://tourduvalat.org/en/publications-en/mediterranean-wetlands-outlook-3-mwo-3/
Nyhus P.J. 2016. Human–Wildlife Conflict and Coexistence. Annual Review of Environment and Resources 41:143–171. doi: 10.1146/annurev-environ-110615-085634
Perennou C., Beltrame C., Guelmami A., Tomàs Vives P., Caessteker P. 2012. Existing areas and past changes of wetland extent in the Mediterranean region: an overview. ecmed 38:53–66. doi: 10.3406/ecmed.2012.1316
Rigal S., Dakos V., Alonso H., Auniņš A., Benkő Z., Brotons L., Chodkiewicz T., Chylarecki P., de Carli E., del Moral J.C., Domşa C., Escandell V., Fontaine B., Foppen R., Gregory R., Harris S., Herrando S., Husby M., Ieronymidou C., Jiguet F., Kennedy J., Klvaňová A., Kmecl P., Kuczyński L., Kurlavičius P., Kålås J.A., Lehikoinen A., Lindström Å., Lorrillière R., Moshøj C., Nellis R., Noble D., Eskildsen D.P., Paquet J.-Y., Pélissié M., Pladevall C., Portolou D., Reif J., Schmid H., Seaman B., Szabo Z.D., Szép T., Florenzano G.T., Teufelbauer N., Trautmann S., van Turnhout C., Vermouzek Z., Vikstrøm T., Voříšek P., Weiserbs A., Devictor V. 2023. Farmland practices are driving bird population decline across Europe. Proceedings of the National Academy of Sciences 120:e2216573120. doi: 10.1073/pnas.2216573120
Waters C.N., Zalasiewicz J., Summerhayes C., Barnosky A.D., Poirier C., Gałuszka A., Cearreta A., Edgeworth M., Ellis E.C., Ellis M., Jeandel C., Leinfelder R., McNeill J.R., Richter D. deB., Steffen W., Syvitski J., Vidas D., Wagreich M., Williams M., Zhisheng A., Grinevald J., Odada E., Oreskes N., Wolfe A.P. 2016. The Anthropocene is functionally and stratigraphically distinct from the Holocene. Science 351:aad2622. doi: 10.1126/science.aad2622